50年代初，日本渔船曾大批进入中国沿海渔场，掠夺水产资源，损坏我渔船网具，为此双方发生渔业争端。为和平解决，遵照周恩来总理指示，由两国民间渔业团体进行谈判。为此1954年11月成立了中国渔业协会，并于1955年开始了第一次中日民间渔业谈判，并签订了《中华人民共和国渔业协会和日本国日中渔业协会关于黄海、东海渔业的协定》。 1963年、1965年又分别签订了第二次、第三次民间渔业协定。1970年为补充协定条款，双方渔协代表团签署了会谈公报，同年12月又签订了关于灯光围网渔船捕鱼的规定，并将此作为中日民间渔业协定的组成部分。中日邦交正常化后，中日两国政府于1975年签订了中日渔业协定，民间渔业协定随之失效。根据中日渔业协定及同意事项记录，双方渔协仍应协助政府有关部门指导渔船进行安全作业，解决海事纠纷和处理渔船海损赔偿等问题，遂于1975年签订了《中国渔业协会和日本渔业协议会渔业安全作业议定书》。中国渔业协会为民间性质的群众团体，宗旨是维护我国渔业权益和渔民利益。发展同其他国家的民间渔业交流和合作关系，现任会长肖鹏，副会长李仁培，渔协办公室设于农业部渔业局内。