国家海洋局东海分局创建于1965年，为国家海洋局在东海区的派出机构，属于行政事业单位，履行北起连云港、南至诏安头东海海域权益管理、海洋资源综合开发利用、海洋环境保护等职能，实施海洋综合管理；负责本海域的海洋减灾、防灾工作，为社会提供公益服务；执行国家下达的海洋科学调查研究和南极考察等重大任务；负有本海域海洋事务协调功能。
东海分局现驻上海市浦东新区，在江浙沪闽设有分支管理机构，现有编制实力1800多人，拥有远洋科学考察船3艘、中国海监飞行等海洋环境监视监测网的海洋管理体制和运行机制，具有海洋自动透测浮标和岸站观测点相协同的海洋要素监控系统。1991年，根据国家编委的批复，在东海分局增挂了上海市海洋局牌子，开始属于上海市海洋综合管理的职能。
