该所原名“重庆市长寿湖水产研究所”，始建于1958年，是重庆市科研事业单位。全所职工48人，其中高、中科技人员20人，主要从事淡水鱼类养殖、名特水产动物移养驯化、水产新品种、新技术的引进试验示范等应用技术研究工作，并对全市渔业生产技术进行指导。

    该所在大中型水库渔业资源开发利用、池塘养鱼高产技术等方面的研究，在水产新品种、新技术的区域性试验和推广方面取得了多项成果，推进了全市水产生产的发展。曾先后获多项省、市科技进步奖和重大科技成果奖。该所开展的长江鲟内塘驯化繁殖研究和中华鲟（雄）与长江（雌）的人工杂交及其子一代内塘驯化繁殖研究，首创了我国鲟鱼类驯化繁殖的成功记录，获国家级科技进步奖。

    该所在深化改革中，已在水库和长江建立网箱养鱼产业化基地三处及其配套的名特水产苗种场和鱼饲料厂。年产河鲶、鲤鱼等多种商品鱼500吨，其发展目标是在即将建成的三峡水库建立年产万吨、产值超亿元的水产科技集团企业。