该所前身为海南水产研究所，创办于1959年，1989年改为现名。1959年到1961年，负责人许高宜(副所长、高工)；1961年到1963年负责人云林(副所长、工程师)；1964年至1982年负责人陈乃书(副所长、高工)；1982至1984年，所长韩凤阁；1984至1992年，所长王鹏(高工、国务院特贴专家)；1992年迄今，负责人许志坚(副所长、高工、国家中青年专家)。隶属海南省水产局。占地3500平方米，建筑3300平方米。

    研究方向：主要从事鱼虾贝藻类的增养殖、苗种培养、病害防治、新品种培育等应用开发研究。研究机构：设有海水养殖、淡水养殖、捕捞资源、水产加工等4个研究室，3个试验基地。人员结构：现有职工38人。其中高级职称4人。中级职称12人，高等学历12人。主要成果：“大珠母贝的离游有核珍珠及人工育苗研究”项目，1986年获广东省科学技术二等奖。“斑节对虾人工繁殖技术研究”项目，1990年获海南省科学技术进步二等奖。设施仪器：仪器设备总值15万元。藏书：12万册。