北京市水产科学研究所于1958年成立，占地面积20公顷，其中试验池7公顷。所内建有科研办公楼3000平方米，试验温室四栋计2000平方米，保温大棚三栋计4000平方米；具有国际先进水平试验仪器80余台（件）；还挖掘地热井一口，出口水温53℃，日出水量千立方米。为水产常年养殖和科学试验提供了条件。此外，所内还建有科研中试基地，下设名优品种苗种生产车间、饲料加工车间、鱼药生产车间、饲料生产车间以及甲鱼工厂化养殖车间。现有职工近140人，具有高级职称的技术干部占15%以上，中级职称占40%。主要从事水产养殖品种、饲料、鱼病、增养殖技术、生物工程和渔业环境保护等科学研究工作。建所以来，共有100多项科研成果通过鉴定，其中32项科研成果获国家、农业部和市科委有关部门的奖励。科研中试基地现进行名优水产品苗种、饲料、添加剂、鱼药产品的开发、推广的良性循环机制。

    该所计划建成一个集科研与产品开发为一体的科研机构，将利用生物工程等高新技术，开展鱼类育种、工厂化养殖、鱼类营养与饲料配制、鱼病防治和水产品综合加工等科研开发工作。